国体を否定し又は神宮若は皇室の尊厳を冒涜すべき事項を流布することを目的して結社を組織したる者又は結社の役員其の他指導者たる任務に従事したる者は無期又は４年以上の懲役に処し（治安維持法=昭和１６年改正／『牧口常三郎全集』第１０巻４４４頁）
昭和１６年といえば、太平洋戦争勃発の年である。＜逮捕前の指導＞
最近、文部省が軍事訓練を課したるは、近ごろの大できである。……何という、今の非常国家に適切の忠告であろう（牧口常三郎「『光瑞縦横談』と教育・宗教革命」昭和１１年／『フォーラム２１』H14.3.15）
牧口学会は、太平洋戦争勃発以前より、軍国主義教育の推進に加担していたのである。
（※宮城遥拝・黙祷の後、野島辰次理事「開会の辞」）大東亜戦開始以来の戦果は、法華経の護持国家なればこそであります。昨夜のラヂオ放送の如き余裕下に、今日総会を開くのは感激の極みであります（昭和１７年５月１７日・創価教育学会第４回総会『大善生活実証録』／『フォーラム２１』H14.3.15）
大東亜戦争（太平洋戦争）で赫々たる戦果があがっているのは、日本が法華経の護持の国であればこそであり、勝利の戦果を聞く時に総会を開催することは感激の極みだというのである。宮城遥拝に次いで首脳幹部が大東亜戦争の戦果を賞賛する。ここには侵略戦争に反対したという事実も、軍国主義に抵抗した事実も全く見あたらない。あるのは「侵略戦争」に迎合協力する体制翼賛団体としての創価教育学会の姿だけである。
吾々（われわれ）は日本国民として無条件で敬神崇祖をしてゐる。しかし解釈が異なるのである。神社は感謝の対象であって、祈願の対象ではない。吾々が靖国神社へ参拝するのは（中略）お礼、感謝の心を現はすのであって、御利益をお与え下さい、といふ祈願ではない。（中略）今上陛下こそ現人神であらせられる（昭和１７年１１月・第５回総会『大善生活実証録』／『牧口常三郎全集』第１０巻３６２頁）
"感謝のためなら神社に参拝してもよい"これが牧口会長の指導でした。